Sebuah festival olahraga antarsekolah di Academy City. Mikoto Misaka, siswi level 5 dengan kekuatan elektromagnetik, awalnya hanya ingin bersenang-senang di Daihasei Festival. Tapi diam-diam ada konspirasi yang mengincar para level 5. Kelompok misterius mulai bergerak di balik layar, dan Mikoto mendapati dirinya bukan hanya lawan di arena — tapi sasaran empuk. Teman-temannya ikut terseret, dan festival berubah jadi medan pertempuran. Yang bikin penasaran: siapa dalang di balik semua ini, dan apa hubungannya dengan eksperimen rahasia Academy City?