Gali tanah setiap hari, itulah hidup Simon di desa bawah tanah yang gelap. Tapi kakak angkatnya Kamina punya mimpi gila — menembus langit-langit gua dan lihat permukaan yang katanya ada di atas sana. Simon yang pemalu cuma ikut-ikutan sampai suatu hari dia menemukan mecha kecil bernama Lagann, dan dari situ semuanya berubah. Mereka berdua berhasil ke permukaan, lalu ketemu perang melawan pasukan Lordgenome yang menguasai dunia. Dari bertahan hidup, perlawanan mereka melebar jadi pertempuran antargalaksi yang nggak masuk akal tapi seru. Yang bikin penasaran, sejauh mana semangat manusia bisa mendorong mereka melawan takdir?