Kloningan diciptakan sebagai senjata. Tapi Mewtwo punya pikiran dan perasaan sendiri — dan itu jadi masalah besar. Setelah sadar keberadaannya cuma alat, ia memberontak. Menantang semua Pokémon dan manusia untuk duel. Buktikan siapa yang lebih kuat, orisinal atau tiruan? Tapi pertarungan ini bukan sekedar adu kekuatan. Mewtwo mau balas dendam, mau diakui eksistensinya. Di tengah kekacauan, Ash dan Pikachu terjebak antara kawanan Pokémon hasil kloning dan yang asli. Semua saling serang, semua bingung siapa musuh. Apakah kloningan layak disebut hidup?