Berkat Isao Shinomiya, Kafka Hibino selamat dari dikorupsi jadi senjata. Saat rekrutan baru bergerak ke pos, dia bertemu Jenderal Narumi — manusia terkuat di Angkatan Pertahanan, pemimpin Divisi Pertama. Kafka pakai kekuatan Kaiju No. 8 buat memaksa Gen mengakui kemampuannya. Tapi di balik semua itu, Kaiju No. 9 mengintai. Ancaman terbesar yang pernah dihadapi Angkatan Pertahanan belum muncul.