Boneka misterius tiba-tiba muncul dan mulai menyerang kota. Di sisi lain, Illya dan teman-temannya harus menghadapi ancaman baru yang lebih aneh dari sebelumnya. Mereka kaget saat kartu Class Card yang dulu mereka kumpulkan mendadak aktif lagi dengan kekuatan berbeda. Belum selesai masalah di dunia nyata, mereka malah terseret ke dimensi lain yang nggak dikenal. Di sana, ada seorang gadis misterius yang diam-diam mengawasi pergerakan mereka. Entah sekutu atau musuh, yang pasti dia menyembunyikan sesuatu tentang asal-usul Illya yang nggak pernah terungkap sebelumnya.