Siapa bilang anak SD nggak bisa jadi jenderal perang? Taiki Kudo, bocah baik hati yang selalu bantuin orang, tiba-tiba tersedot ke Dunia Digital. Di sana ia dapat Xros Loader—gadget ajaib yang bisa menggabungkan Digimon jadi satu makhluk raksasa. Bersama teman-temannya, Taiki harus menghadapi Bagra Army pimpinan Lord Bagramon yang ingin menguasai seluruh dunia digital. Tapi semakin dalam Taiki menyatu dengan kekuatan Fusion, semakin aneh suara di kepalanya—seolah ada sesuatu yang menunggu di balik takdirnya.