Lima anak biasa tiba-tiba tersedot ke dunia digital. Bedanya dari Digimon lain, mereka nggak punya partner—malah jadi Digimon sendiri. Takuya, Koji, Izumi, Junpei, dan Tomoki melebur dengan roh kuno untuk berubah jadi hybrid. Mereka harus kumpulin semua Spirit sebelum Cherubimon yang korup menghancurkan semuanya. Tapi makin jauh mereka melangkah, makin terasa ada sesuatu yang disembunyikan. Siapa dalang di balik kekacauan ini? Dan kenapa roh-roh itu memilih mereka?