Setelah pertarungan sengit melawan Meicoomon, dunia mulai terbalik. Taichi dan kawan-kawan mendapati satu per satu teman mereka menghilang tanpa jejak, termasuk Agumon dan Digimon lainnya. Yang tersisa hanya ingatan yang mulai kabur, seolah keberadaan mereka dihapus dari sejarah. Di tengah kekacauan itu, Hikari diam-diam menyembunyikan sesuatu yang berhubungan dengan asal-usul Meicoomon — dan rahasia itu bisa menghancurkan ikatan antara manusia dan Digimon selamanya. Siapa sangka musuh terbesar bukan datang dari luar, tapi dari luka lama yang tak pernah sembuh. Apakah persahabatan bisa bertahan ketika kenyataan sendiri mulai runtuh?