Setahun setelah kegagalan Black Rebellion, dan Lelouch lupa siapa dirinya. Kaisar Britannia menghapus ingatannya, bikin dia hidup polos kayak siswa biasa — sampai C.C. datang dan balikin semua memori pahit itu. Kembali jadi Zero, dia harus hadapi Suzaku yang sekarang jadi Knight of Seven, sambil bongkar rencana kegelapan Kaisar yang ternyata punya konspirasi jauh lebih besar. Yang bikin makin runyam, teman-teman lamanya di Sekolah Ashford mulai curiga. Ujung-ujungnya semua jalan menuju satu rencana gila yang disebut Zero Requiem — solusi damai yang mungkin lebih kejam dari perang itu sendiri. Tapi, apa harga yang harus dibayar buat 'perdamaian' macam ini?