Seorang pria bernama Satoru Fujinuma memiliki kemampuan aneh—ia bisa kembali ke masa lalu sebelum sebuah kejadian tragis terjadi. Tapi saat ibunya dibunuh, ia terlempar 18 tahun ke belakang, ke masa SD. Di sana, tiga anak perempuan hilang dan seorang teman sekelasnya, Kayo Hinazuki, hidup dalam bayang-bayang kekerasan. Satoru sadar: kalau mau selamatkan ibunya, ia harus ubah masa lalu. Tapi pelaku pembunuhan mungkin masih ada di sekitarnya, dan waktu terus berdetak.