Kakao di Bumi hampir habis. Bukan karena manusia kebanyakan minum cokelat panas, tapi alien datang khusus buat mencurinya. BoBoiBoy, bocah biasa yang tiba-tiba punya kekuatan super, jadi satu-satunya harapan planet ini. Bersama teman-temannya, dia harus hadapi serbuan makhluk luar angkasa yang nggak main-main. Tapi kekuatannya masih baru, musuh makin banyak, dan waktu terus berjalan. Mampukah seorang anak kecil menghentikan pencurian kakao terbesar sejagat?