Siapa yang menyangka kalau laporan pencurian laptop ternyata ujung-ujungnya mengarah ke konspirasi nuklir? Tim NCIS pimpinan Leroy Jethro Gibbs, dimainkan oleh Mark Harmon, bukan tim forensik biasa. Mereka menyelidiki kejahatan yang nyangkut langsung dengan Angkatan Laut dan Korps Marinir — dari pembunuhan, terorisme, sampai bocornya data rahasia. Di setiap episode, Gibbs bersama Anthony DiNozzo (Sean Murray) dan Dr. Donald Mallard (David McCallum) harus memilah antara fakta dan kebohongan di lapangan. Tapi yang bikin tegang, pelaku seringkali bukan orang luar, melainkan orang dalam yang diam-diam punya agenda sendiri. Pertanyaannya, berapa banyak rahasia yang masih tersembunyi di balik seragam militer itu?